Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms