Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms