Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms