Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms