Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc30a1Q99J38 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms