Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Cldn16Q925N4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Cldn16Q925N4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Cldn16Q925N4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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