Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms