Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms