Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms