Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms