Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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