Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms