Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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