Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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