Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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