Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms