Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Habp2Q8K0D2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Habp2Q8K0D2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms