Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm28Q8CGC6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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