Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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