Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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