Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pramef8Q8CE24 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pramef8Q8CE24 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pramef8Q8CE24 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef8Q8CE24 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms