Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CDS7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CDS7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms