Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms