Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms