Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms