Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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