Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strip1Q8C079 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms