Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp43Q8BUM9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp43Q8BUM9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms