Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms