Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms