Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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