Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms