Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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