Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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