Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms