Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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