Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sarm1Q6PDS3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms