Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms