Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttbk1Q6PCN3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttbk1Q6PCN3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttbk1Q6PCN3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttbk1Q6PCN3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttbk1Q6PCN3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ttbk1Q6PCN3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttbk1Q6PCN3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttbk1Q6PCN3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms