Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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