Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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