Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CltcQ68FD5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms