Protein–RNA interactions for Protein: Q641K1

Agtpbp1, Cytosolic carboxypeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtpbp1Q641K1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Agtpbp1Q641K1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms