Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hcfc1Q61191 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hcfc1Q61191 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hcfc1Q61191 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hcfc1Q61191 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms