Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms