Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms