Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CttnQ60598 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CttnQ60598 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.6 ms