Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf123Q5XPI3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms