Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trim38Q5SZ99 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trim38Q5SZ99 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trim38Q5SZ99 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim38Q5SZ99 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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