Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms